1) Настроил синхронизацию прямым подключением

В какой то момент нужно было отключить автоматический обмен.
Я зашел в сценарии и отключил расписание синхронизации.(кнопкой в виде часов)

Но говорят оно все равно проходит.

Что тогда делает кнопка "Включить или отключить загрузку и выгрузку данных"?

2. Отправка и получение данных проходит в одной транзакции или нет? Т.е. если отправка не происходит по какой то ошибки - загрузка пройдет или нет?

3. При прямом подключение расписание синхронизации настраивать в двух базах или в одной?

в двух конечно же

(1) это ответ на какой вопрос? Про транзакции или про настройку расписания?

Просто при прямом подключение достаточно запустить синхронизацию в одной базе

на оба

(3) ну и какой смысл в расписание с двух сторон, если нажать на одной стороне синхронизацию. то синхронизация проходит и в первой и во второй базах

И знаешь ответы 2 других вопроса?