Реквизит - поставщик, и это может быть несколько контрагентов (так пользователь видит) - через регистр только можно реализовать?

Через ТЧ.

(0) универсального правильного решения для реализации хранения отношений один-ко-многим не существует. Без конкретики советы будут бестолковыми.