Написать текст запроса ручками, без использования конструктора.
Либо запускать конструктор там, где этот регистр будет виден, - в расширении (например из модуля набора зписей этого регистра). Но в таком случае в конструкторе тебе будут доступны только таблицы, имеющиеся в расширении, а таблицы основной (расширяемой) конфигурации, но не включенные в расширение, - нет.
Есть другой способ. Создавать запрос в консоле запросов в толстом клиенте в пользовательском приложении. В конструкторе запроса видны все таблицы.
Я не хочу быть самым богатым человеком на кладбище. Засыпать с чувством, что за день я сделал какую-нибудь потрясающую вещь — вот что меня интересует. Стив Джобс