(0) Если по портам разнес корректно, то всё должно работать.
У нас была похожая проблема, но только при обновлении версии платформы 8.2. После удаления старой версии 8.2 в реестре всегда оставались "хвосты" от предыдущей версии, которые приходилось удалять вручную. Без удаления старых ключей служба 1С 8.2 падала (останавливалась) сразу после старта.
Чтобы обнаруживать ошибки, программист должен иметь ум, которому доставляет удовольствие находить изъяны там, где, казалось, царят красота и совершенство. Фредерик Брукс-младший