Кто знает есть ли какая, возможность вести такой товар в рознице, или может какой-то выход?
или только в связке с УТ прокатит (?

(0) в связке с БП работаем, может есть какой вариант, чтобы в БП это учитывалось?

У вас только комиссионный товар, собственного нет?

(2) в основном собственный и часть комиссии

Сейчас как-нибудь взаимодействие БП-Розница настроено?

(4) да, настроено через стандартный план обмена, думаю попробовать через создание договора (комиссии) по контрагенту в БП

Вид договора можно разрулить перепелив правила и взяв, например, вид договора из доп.реквизита контрагента в рознице. А счета учета номенклатуры  - раскидай номенклатуру в разные папки и установи счета учета на них.