Чего-то совсем грустно..
При подразделении в 1ДФ не высвечивается..
Два договора с разными подразделениями в расчетной ведомости показывают одно и то же удержание НДФЛ и ЕСВ в каждом подразделении - задваивается. Поговорите с мной кто-нибудь

А если рассчитывать по подразделениям?

В регистре расчетов фонды в случае ГПХ подразделение не заполнено, расчетная ведомость складывает регистр сведений сотрудники со списком договоров криво, в 1ДФ договорники по подразделениям не фильтруются, только сотрудники оргазаций.

Я расчитываю одного сотрудника по двум договорам подряда с разными подразделениями

В шапке подразделение заполено, даже если договор один, в регистр он не попадает.
В 1ДФ ГПХ шников вручную..

Решается приемом ГПХ-шников в штат и двумя назначениями - основным и договорным. Указать подразделение можно только в основном назначении, если оно есть, то все срастается.