Если в условии указываю чтобы номенклатура вытягивалась с табличной части документа, количество всегда возвращается 0, что не так делаю?

ИЗ
   РегистрНакопления.РезервПоКонтрагенту.Остатки(
           ,
           Склад = &СписокСкладов
               И Номенклатура В
                   (ВЫБРАТЬ РАЗЛИЧНЫЕ
                       Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары.Номенклатура
                   ИЗ
                       Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары
                   ГДЕ
                       Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары.Ссылка = &ДокументСсылка)) КАК РезервыБезКонтрагента

Странный какой-то текст:
"ВЫБРАТЬ РАЗЛИЧНЫЕ                        Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары.Номенклатура".
Это консоль такой текст сваяла? Может просто "Номенклатура"?

Склад = &СписокСкладов как-то не внушает доверия.

Исправь запрос по номенклатуре в параметрах:

ВЫБРАТЬ РАЗЛИЧНЫЕ
  ТЧТовары.Номенклатура
ИЗ
  Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары КАК ТЧТовары
ГДЕ
  ТЧТовары.Ссылка = &ДокументСсылка

Это кусок проверь:
ВЫБРАТЬ РАЗЛИЧНЫЕ
                       Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары.Номенклатура
                   ИЗ
                       Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары
                   ГДЕ
                       Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары.Ссылка = &ДокументСсылка

может он пусто возвращает

----------------------------------------
 Это что за явление Пупа народу !?
----------------------------------------

ВЫБРАТЬ РАЗЛИЧНЫЕ
   Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары.Номенклатура
ИЗ
   Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары
ГДЕ
   Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары.Ссылка = &ДокументСсылка

----------------------------------------
 Замени-ка на
----------------------------------------

ВЫБРАТЬ РАЗЛИЧНЫЕ
   Товары.Номенклатура
ИЗ
   Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары КАК Товары
ГДЕ
   Товары.Ссылка = &ДокументСсылка

(5) а потом замени на временную таблицу с индексом по номенклатуре.