стоит 8.2.17
по идее в ней можно делать так:

ХранилищеСистемныхНастроек.Удалить("Общее/НастройкиКлиентскогоПриложения",Неопределено,Неопределено);
настр = Новый НастройкиКлиентскогоПриложения;
настр.ОтображатьПанельРазделов = Ложь;
настр.ОтображатьПанелиНавигацииИДействий = Ложь;
ХранилищеСистемныхНастроек.Сохранить("Общее/НастройкиКлиентскогоПриложения",,настр);

Отладчиком проверил, в настройки ЛОЖЬ заносится.
Но панель видна, даже после перезапуска 1с.

Как ее скрыть?

ап

Для начала поробуй посмотреть чего там в настройках есть


Выборка=ХранилищеСистемныхНастроек.Выбрать(Новый Структура("Пользователь",ПараметрыСеанса.ТекущийПользователь));
Пока Выборка.Следующий() Цикл
       Сообщить(""+Выборка.КлючНастроек+" "+Выборка.КлючОбъекта+" "+Выборка.Настройки);
КонецЦикла;