Такая ситуация: Есть запрос

ВЫБРАТЬ
   РеализацияТоваровУслуг.Ссылка
ПОМЕСТИТЬ РТУ
ИЗ
   Документ.РеализацияТоваровУслуг КАК РеализацияТоваровУслуг
ГДЕ
   РеализацияТоваровУслуг.ДатаДвижения МЕЖДУ &НачалоПериода И &КонецПериода
   И РеализацияТоваровУслуг.Проведен = ИСТИНА
;

////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
ВЫБРАТЬ
   РТУ.Ссылка
ИЗ
   РТУ КАК РТУ
       ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ РегистрНакопления.Продажи.Обороты(, , Регистратор, ) КАК ПродажиОбороты
       ПО РТУ.Ссылка = ПродажиОбороты.Регистратор
ГДЕ
   ПродажиОбороты.Регистратор ЕСТЬ NULL

Самый банальный, чья цель - выявить документы, не прошедшие по регистру Продажи. Проверяю в консоли запросов, выводит корректно. СКД выдает серию документов, которые прошли по регистру. Где искать косяк?

попробуй соединить не с виртуальной "обороты", а с физической

РегистрНакопления.Продажи.Обороты({&ПустаяДата}, {&ПустаяДата}, Регистратор, )

вот так попробуй
Скорее всего срабатывает автозаполнение в СКД - берет в качестве периода не весь, а подставляет НачалоПериода и КонецПериода

выгрузи в xml схему СКД и прочитай какой там получился запрос

(1) С физической получилось. Почему может быть такая ерунда?

якобы в виртуальной таблице не отразился регистратор?

Вопрос: Почему регистратор есть в физической таблице, но нет в виртуальной?

Попробуй с виртуальной добавить группировку по периоду Секунда