При создании "Реализации" на основании "Заказа покупателя", реализация создается пустая. Полагаю из за того, что в регистре "Товары организаций" по этой организации ничего нет (а по другой кстати есть). Остатки переносились из 1с 7.7. По обоим организациям есть документ Оприходование товаров, созданный при переносе остатков. В чем может быть косяк или можно ли сделать, чтобы при создании реализации остатки брались с остатков складов, а не организаций без переписывания конфигуры?

Посмотри в настройках пользователя какие склады у него прописаны ("Основной склад" или "Группы доступности складов"),елси зарезервировано на складах которые недоступны пользователю тогда реализация будет пустая

+(1) Одна организация перенеслась без галочки "Отражать в регл. учете"! Из за этого остатков не было, но реализации пока все равно пустые создаются.

(2) Стоит Группы доступности складов, там есть этот склад.

Док реализация заполняется с учетом
1) остатка по заказу
2) остатка на складе
как-то так, мне помнится