Вот еще ссылка для решения этой задачи: "Как нарисовать граф на 1С"
http://catalog.mista.ru/public/196899/ . Там есть готовая обработка, рисующая граф по списку его дуг. Не такая универсальная как graphviz , но зато чисто на 1С. Для небольших графов.